Конкретные эпитопы RNLS способствуют получению самых высоких электростатических CS на основе TCR CDR3, полученных из файлов TCGA-SKCM WXS и RNAseq. Гистограммы отображают частоту распределения остатков аминокислот (AA) RNLS, которые перекрывают TCR CDR3, которые представляют самые высокие электростатические CS (методы). Ось X представляет положение AA для RNLS; ось Y представляет количество отсчетов, где каждый отсчет соответствует количеству раз, когда AA в RNLS перекрывает CDR3. Стрелка обозначает пиковую частоту распределения, соответствующую RP220. Карты эпитопов были созданы с использованием TCR CDR3, полученных из (A) файлов TCGA-SKCM WXS и (B) файлов TCGA-SKCM RNAseq. Кредит: Oncotarget (2024). DOI: 10.18632/oncotarget.28633
Новая исследовательская работа под названием «Химическая комплементарность резидентных опухолей, рецепторов Т-клеток CDR3 и реналазы-1 коррелирует с повышенной выживаемостью при меланоме» была опубликована в Oncotarget.
Как упоминалось в аннотации этого исследования, повышенная экспрессия секреторного белка реналазы-1 отрицательно влияет на выживаемость пациентов с меланомой и раком поджелудочной железы, в то время как ингибирование сигнализации реналазы-1 стимулирует отторжение опухоли, способствуя активации Т-клеток.
Таким образом, исследователи Саиф Заман, Фред С. Горелик, Андреа Хробруцкий, Борис И. Чобруцкий, Гэри В. Дезир и Джордж Бланк из Йельской школы медицины, Системы здравоохранения Администрации по делам ветеранов, Университетской больницы здравоохранения и науки Орегона, Медицинского колледжа Морсани и Научно-исследовательского онкологического центра им. Х. Ли Моффита изучили химическую комплементарность между аминокислотными последовательностями (АА) 3-го региона (CDR3) рецептора Т-клеток (TCR), определяющего комплементарность, резидентного в меланоме, и белком реналазы-1.