Уточненные прогностические подтипы, полученные из 1063 транскриптомов колоректального рака. Кредит: Nature (2024). DOI: 10.1038/s41586-024-07769-3
Используя уникальную коллекцию генетических и клинических данных по колоректальному раку, исследователи из Уппсальского университета выявили новые генетические изменения и разработали новый молекулярный классификатор вариантов опухолей. Это открытие может привести к улучшению возможностей для индивидуализированной терапии. Это показано в исследовании, недавно опубликованном в журнале Nature.
Колоректальный рак — третий по распространенности и второй по смертности тип опухолей. Заболевание вызывается мутациями в генах-драйверах рака, которые приводят к неконтролируемому росту клеток.
Чтобы понять связь между генетическими изменениями и развитием заболевания и прогнозом, исследователи из Уппсалы и их коллеги секвенировали ДНК из опухолевых и нормальных тканей более тысячи пациентов с колоректальным раком.
«Поскольку у нас также есть доступ к клинической информации от этих пациентов, наша работа привела к созданию одной из крупнейших в мире когорт колоректального рака с комплексными клиническими и геномными данными. Масштаб этого набора данных является новаторским и предлагает большой объем информации для ученых в этой области», — говорит Тобиас Сьёблом, профессор кафедры иммунологии, генетики и патологии и один из исследователей, руководивших исследованием.
В первой публикации когорты исследователи идентифицировали почти сто мутировавших генов-драйверов рака. Из них 9 были новыми для колоректального рака, а 24 — для любого вида рака. Исследователь также изучил, какие виды генетических изменений присутствовали, включая небольшие мутации и более крупные структурные вариации, а также изменения, которые влияли на активность генов.
«Полученную нами генетическую информацию затем сравнивали с клинической информацией, особенно с данными о выживаемости: таким образом мы определили ключевые прогностические геномные изменения в конкретных группах пациентов. Некоторые из этих результатов подтверждают предыдущие исследования, в то время как другие являются новыми открытиями», — говорит Луис Нуньес, научный сотрудник кафедры иммунологии, генетики и патологии Уппсальского университета и один из первых авторов исследования.
Ученые также использовали результаты исследования для разработки новой стратегии молекулярной классификации колоректального рака. .
«Наш классификатор основан на активности генов, и благодаря этому мы могли бы эффективно разделить большинство опухолей на пять прогностических подтипов с четкими молекулярными особенностями. Это уточняет и дополняет предыдущие классификаторы подтипов колоректального рака и обеспечивает более четкую прогностическую картину различных групп опухолей». «, — говорит Нуньес.
Ученые, стоящие за исследованием, считают, что открытие ими прогностических мутаций и новых молекулярных подтипов опухолей важно как для будущих исследований генов колоректального рака, так и для разработки инновационных диагностических и терапевтических стратегий.
«Наше исследование знаменует собой значительный шаг вперед в борьбе с колоректальным раком. Мы надеемся, что оно приблизит нас к точной медицине с более эффективными методами лечения и улучшением результатов лечения пациентов», — говорит Сьёблом.
Исследование проводилось в сотрудничестве с исследователями Каролинского института, Университета Умео и BGI Genomics в Китае.
Дополнительная информация: Тобиас Шёблом, Prognostic Сигнатуры генома и транскриптома при колоректальном раке, Nature (2024). DOI: 10.1038/s41586-024-07769-3. www.nature.com/articles/s41586-024-07769-3
Информация журнала: Nature Предоставлено Уппсальским университетом
