Сопоставление показателей склонности обеспечивает более эффективное обнаружение биомаркеров в исследованиях рака

Важные новости

Сопоставление оценок склонности обеспечивает более эффективное использование Открытие биомаркеров в исследованиях рака» /></p>
<p> Распределение оценок предрасположенности набора данных IHC CRC. Фото: <i>PLOS ONE</i> (2024 г.). DOI: 10.1371/journal.pone.0302109 </p>
<p>Благодаря достижениям в области молекулярного секвенирования ученые получили огромное количество данных о геноме, транскриптоме, протеоме и метаболоме. Однако эти наборы данных «-omics» сложны, и в настоящее время не существует стандартного метода анализа данных для отделения конкретных биомаркеров от возможных искажающих переменных.</p>
<p>В недавнем исследовании ученые из Медицинского центра Бет Исраэль Диаконесса (BIDMC) оценили статистический метод, уже используемый в других областях, чтобы минимизировать мешающие факторы и повысить его эффективность при омическом анализе в двух наборах данных о колоректальном раке (CRC). Работа опубликована в журнале <i>PLOS ONE</i>.</p>
<p>Результаты группы показывают, что метод, известный как сопоставление показателей склонности (PSM), может оказаться эффективным и экономически выгодным. стратегия мультиомного анализа данных и дизайн клинических исследований для обнаружения биомаркеров.</p>
<p>Автор-корреспондент Майкл Х. Рёрл, доктор медицинских наук, магистр делового администрирования, заведующий отделением патологии BIDMC, и его коллеги использовали архивные образцы тканей для сортировки случаев рака на группы с хорошим или плохим прогнозом на основе информации о выживаемости пациентов. Затем группы сравнивали, чтобы выявить прогностические биомаркеры белка или транскрипта.</p>
<p>Один набор данных был получен из профилей протеомной экспрессии 544 хирургически удаленных тканей CRC, полученных из архивов патологий крупного академического медицинского центра. В эту группу вошли 367 пациентов, которые прожили более трех лет без рецидивов (группа хороших результатов) и 60 пациентов, у которых рецидив произошел в течение трех лет (группа плохих результатов). Вторая группа состояла из профилей секвенирования РНК 163 случаев КРР, 130 из которых относились к группе с хорошим прогнозом, а 33 из них относились к группе с плохим прогнозом.</p>
<p>В отличие от обычного анализа, который обычно сравнивает рандомизированные когорты больных рака и нормальных тканей, PSM позволил провести прямое сравнение характеристик пациентов, открыв новые прогностические биомаркеры. Создав оптимально подобранные группы для минимизации мешающих эффектов, это исследование продемонстрировало, что PSM обеспечивает надежное извлечение важных биомаркеров, требуя при этом меньше случаев рака и меньшие общие когорты пациентов.</p>
<p><strong>Дополнительная информация :</strong> Масаки Маэкава и др., Сопоставление показателей склонности как эффективная стратегия дизайна когорты биомаркеров и анализа данных омики, <i>PLOS ONE</i> (2024). DOI: 10.1371/journal.pone.0302109 </p>
<p><strong>Информация журнала:</strong> PLoS ONE Предоставлено Медицинским центром Бет Исраэль Диаконесса</p>
</div></div><div class=

Новости сегодня

Последние новости